O orçamento liquidado da Comissão Nacional de Energia Nuclear (UO 24204), vinculada ao MCTI, apresentou pouca variação entre 2000 e 2007, registrando uma média de R$ 868 milhões. Apresenta um aumento de 47,51% entre 2007 e 2010, queda até 2012, novo aumento até 2014 (R$ 1,33 bilhão corrigido). A partir de então, é registrada uma variação negativa de 21,90% na comparação 2021-2014.